Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLNQ969V3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLNQ969V3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLNQ969V3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLNQ969V3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NCLNQ969V3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCLNQ969V3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLNQ969V3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCLNQ969V3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCLNQ969V3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCLNQ969V3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCLNQ969V3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCLNQ969V3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCLNQ969V3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCLNQ969V3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCLNQ969V3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NCLNQ969V3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLNQ969V3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLNQ969V3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLNQ969V3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCLNQ969V3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCLNQ969V3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCLNQ969V3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCLNQ969V3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLNQ969V3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCLNQ969V3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCLNQ969V3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLNQ969V3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NCLNQ969V3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCLNQ969V3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCLNQ969V3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCLNQ969V3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCLNQ969V3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCLNQ969V3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCLNQ969V3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCLNQ969V3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCLNQ969V3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCLNQ969V3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCLNQ969V3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCLNQ969V3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCLNQ969V3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms