Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GTF3C6Q969F1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GTF3C6Q969F1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GTF3C6Q969F1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GTF3C6Q969F1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
GTF3C6Q969F1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GTF3C6Q969F1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GTF3C6Q969F1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GTF3C6Q969F1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GTF3C6Q969F1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GTF3C6Q969F1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GTF3C6Q969F1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GTF3C6Q969F1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GTF3C6Q969F1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GTF3C6Q969F1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GTF3C6Q969F1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GTF3C6Q969F1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GTF3C6Q969F1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GTF3C6Q969F1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GTF3C6Q969F1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GTF3C6Q969F1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GTF3C6Q969F1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GTF3C6Q969F1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GTF3C6Q969F1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF3C6Q969F1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF3C6Q969F1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GTF3C6Q969F1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GTF3C6Q969F1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GTF3C6Q969F1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GTF3C6Q969F1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF3C6Q969F1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF3C6Q969F1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GTF3C6Q969F1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GTF3C6Q969F1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF3C6Q969F1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GTF3C6Q969F1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GTF3C6Q969F1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GTF3C6Q969F1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GTF3C6Q969F1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GTF3C6Q969F1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GTF3C6Q969F1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GTF3C6Q969F1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GTF3C6Q969F1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GTF3C6Q969F1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GTF3C6Q969F1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GTF3C6Q969F1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GTF3C6Q969F1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GTF3C6Q969F1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GTF3C6Q969F1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GTF3C6Q969F1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTF3C6Q969F1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTF3C6Q969F1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTF3C6Q969F1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GTF3C6Q969F1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
GTF3C6Q969F1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GTF3C6Q969F1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GTF3C6Q969F1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF3C6Q969F1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF3C6Q969F1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GTF3C6Q969F1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GTF3C6Q969F1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GTF3C6Q969F1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GTF3C6Q969F1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GTF3C6Q969F1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GTF3C6Q969F1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C6Q969F1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C6Q969F1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C6Q969F1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GTF3C6Q969F1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
GTF3C6Q969F1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF3C6Q969F1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF3C6Q969F1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF3C6Q969F1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF3C6Q969F1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GTF3C6Q969F1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GTF3C6Q969F1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GTF3C6Q969F1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GTF3C6Q969F1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF3C6Q969F1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GTF3C6Q969F1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GTF3C6Q969F1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTF3C6Q969F1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTF3C6Q969F1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF3C6Q969F1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms