Protein–RNA interactions for Protein: Q92953

KCNB2, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 2, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB2Q92953 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KCNB2Q92953 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KCNB2Q92953 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KCNB2Q92953 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KCNB2Q92953 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KCNB2Q92953 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KCNB2Q92953 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KCNB2Q92953 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KCNB2Q92953 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KCNB2Q92953 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KCNB2Q92953 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KCNB2Q92953 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KCNB2Q92953 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KCNB2Q92953 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KCNB2Q92953 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KCNB2Q92953 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KCNB2Q92953 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KCNB2Q92953 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KCNB2Q92953 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KCNB2Q92953 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KCNB2Q92953 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KCNB2Q92953 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KCNB2Q92953 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KCNB2Q92953 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KCNB2Q92953 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KCNB2Q92953 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KCNB2Q92953 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
KCNB2Q92953 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KCNB2Q92953 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KCNB2Q92953 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KCNB2Q92953 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KCNB2Q92953 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KCNB2Q92953 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
KCNB2Q92953 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KCNB2Q92953 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KCNB2Q92953 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KCNB2Q92953 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
KCNB2Q92953 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
KCNB2Q92953 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KCNB2Q92953 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KCNB2Q92953 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KCNB2Q92953 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KCNB2Q92953 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KCNB2Q92953 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KCNB2Q92953 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KCNB2Q92953 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KCNB2Q92953 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
KCNB2Q92953 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KCNB2Q92953 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KCNB2Q92953 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KCNB2Q92953 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KCNB2Q92953 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
KCNB2Q92953 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KCNB2Q92953 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KCNB2Q92953 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KCNB2Q92953 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KCNB2Q92953 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KCNB2Q92953 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KCNB2Q92953 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KCNB2Q92953 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KCNB2Q92953 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KCNB2Q92953 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KCNB2Q92953 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
KCNB2Q92953 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KCNB2Q92953 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KCNB2Q92953 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KCNB2Q92953 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
KCNB2Q92953 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
KCNB2Q92953 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KCNB2Q92953 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.8 ms