Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRN2Q92932 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRN2Q92932 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRN2Q92932 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRN2Q92932 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRN2Q92932 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRN2Q92932 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRN2Q92932 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRN2Q92932 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRN2Q92932 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRN2Q92932 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRN2Q92932 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRN2Q92932 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRN2Q92932 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRN2Q92932 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRN2Q92932 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRN2Q92932 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRN2Q92932 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRN2Q92932 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRN2Q92932 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRN2Q92932 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRN2Q92932 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRN2Q92932 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRN2Q92932 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRN2Q92932 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRN2Q92932 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRN2Q92932 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRN2Q92932 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRN2Q92932 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRN2Q92932 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRN2Q92932 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRN2Q92932 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRN2Q92932 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRN2Q92932 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRN2Q92932 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRN2Q92932 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRN2Q92932 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRN2Q92932 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRN2Q92932 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRN2Q92932 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRN2Q92932 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRN2Q92932 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRN2Q92932 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRN2Q92932 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRN2Q92932 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRN2Q92932 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRN2Q92932 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRN2Q92932 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRN2Q92932 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRN2Q92932 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRN2Q92932 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRN2Q92932 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRN2Q92932 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRN2Q92932 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRN2Q92932 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRN2Q92932 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRN2Q92932 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRN2Q92932 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRN2Q92932 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRN2Q92932 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRN2Q92932 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRN2Q92932 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRN2Q92932 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRN2Q92932 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRN2Q92932 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRN2Q92932 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRN2Q92932 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms