Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RAD50Q92878 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RAD50Q92878 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RAD50Q92878 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RAD50Q92878 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RAD50Q92878 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
RAD50Q92878 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD50Q92878 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD50Q92878 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD50Q92878 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAD50Q92878 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAD50Q92878 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD50Q92878 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
RAD50Q92878 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RAD50Q92878 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RAD50Q92878 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAD50Q92878 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAD50Q92878 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAD50Q92878 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RAD50Q92878 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RAD50Q92878 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RAD50Q92878 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RAD50Q92878 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RAD50Q92878 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RAD50Q92878 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RAD50Q92878 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RAD50Q92878 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RAD50Q92878 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RAD50Q92878 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RAD50Q92878 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RAD50Q92878 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RAD50Q92878 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RAD50Q92878 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RAD50Q92878 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RAD50Q92878 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
RAD50Q92878 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
RAD50Q92878 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RAD50Q92878 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RAD50Q92878 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RAD50Q92878 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RAD50Q92878 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RAD50Q92878 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RAD50Q92878 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RAD50Q92878 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
RAD50Q92878 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RAD50Q92878 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RAD50Q92878 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RAD50Q92878 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RAD50Q92878 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RAD50Q92878 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RAD50Q92878 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RAD50Q92878 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RAD50Q92878 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RAD50Q92878 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RAD50Q92878 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
RAD50Q92878 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RAD50Q92878 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RAD50Q92878 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RAD50Q92878 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
RAD50Q92878 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RAD50Q92878 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RAD50Q92878 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RAD50Q92878 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAD50Q92878 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAD50Q92878 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAD50Q92878 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAD50Q92878 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAD50Q92878 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAD50Q92878 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
RAD50Q92878 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RAD50Q92878 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RAD50Q92878 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RAD50Q92878 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms