Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA4Q8NEY3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA4Q8NEY3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA4Q8NEY3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA4Q8NEY3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPATA4Q8NEY3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA4Q8NEY3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA4Q8NEY3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA4Q8NEY3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPATA4Q8NEY3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPATA4Q8NEY3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA4Q8NEY3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA4Q8NEY3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA4Q8NEY3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA4Q8NEY3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPATA4Q8NEY3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA4Q8NEY3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA4Q8NEY3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA4Q8NEY3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA4Q8NEY3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA4Q8NEY3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA4Q8NEY3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA4Q8NEY3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPATA4Q8NEY3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA4Q8NEY3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPATA4Q8NEY3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPATA4Q8NEY3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPATA4Q8NEY3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPATA4Q8NEY3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPATA4Q8NEY3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA4Q8NEY3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA4Q8NEY3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA4Q8NEY3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPATA4Q8NEY3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPATA4Q8NEY3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPATA4Q8NEY3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPATA4Q8NEY3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPATA4Q8NEY3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA4Q8NEY3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPATA4Q8NEY3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPATA4Q8NEY3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPATA4Q8NEY3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPATA4Q8NEY3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPATA4Q8NEY3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SPATA4Q8NEY3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPATA4Q8NEY3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPATA4Q8NEY3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPATA4Q8NEY3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPATA4Q8NEY3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPATA4Q8NEY3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SPATA4Q8NEY3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPATA4Q8NEY3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPATA4Q8NEY3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPATA4Q8NEY3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPATA4Q8NEY3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPATA4Q8NEY3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPATA4Q8NEY3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPATA4Q8NEY3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA4Q8NEY3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA4Q8NEY3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPATA4Q8NEY3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPATA4Q8NEY3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPATA4Q8NEY3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPATA4Q8NEY3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA4Q8NEY3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPATA4Q8NEY3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPATA4Q8NEY3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPATA4Q8NEY3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPATA4Q8NEY3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms