Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCD7Q8N8D1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCD7Q8N8D1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCD7Q8N8D1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCD7Q8N8D1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCD7Q8N8D1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCD7Q8N8D1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCD7Q8N8D1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCD7Q8N8D1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCD7Q8N8D1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCD7Q8N8D1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCD7Q8N8D1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCD7Q8N8D1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCD7Q8N8D1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDCD7Q8N8D1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCD7Q8N8D1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCD7Q8N8D1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCD7Q8N8D1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCD7Q8N8D1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCD7Q8N8D1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCD7Q8N8D1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCD7Q8N8D1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCD7Q8N8D1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCD7Q8N8D1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCD7Q8N8D1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCD7Q8N8D1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDCD7Q8N8D1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDCD7Q8N8D1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDCD7Q8N8D1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDCD7Q8N8D1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCD7Q8N8D1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCD7Q8N8D1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCD7Q8N8D1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDCD7Q8N8D1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCD7Q8N8D1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCD7Q8N8D1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCD7Q8N8D1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCD7Q8N8D1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCD7Q8N8D1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCD7Q8N8D1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCD7Q8N8D1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCD7Q8N8D1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDCD7Q8N8D1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDCD7Q8N8D1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDCD7Q8N8D1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCD7Q8N8D1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCD7Q8N8D1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCD7Q8N8D1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCD7Q8N8D1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCD7Q8N8D1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCD7Q8N8D1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCD7Q8N8D1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCD7Q8N8D1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCD7Q8N8D1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCD7Q8N8D1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCD7Q8N8D1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCD7Q8N8D1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCD7Q8N8D1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCD7Q8N8D1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCD7Q8N8D1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCD7Q8N8D1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCD7Q8N8D1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCD7Q8N8D1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDCD7Q8N8D1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDCD7Q8N8D1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDCD7Q8N8D1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDCD7Q8N8D1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDCD7Q8N8D1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDCD7Q8N8D1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD7Q8N8D1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD7Q8N8D1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD7Q8N8D1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD7Q8N8D1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCD7Q8N8D1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCD7Q8N8D1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCD7Q8N8D1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCD7Q8N8D1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCD7Q8N8D1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCD7Q8N8D1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD7Q8N8D1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDCD7Q8N8D1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCD7Q8N8D1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCD7Q8N8D1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCD7Q8N8D1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCD7Q8N8D1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD7Q8N8D1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD7Q8N8D1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCD7Q8N8D1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCD7Q8N8D1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCD7Q8N8D1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCD7Q8N8D1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms