Protein–RNA interactions for Protein: Q8N350

CBARP, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARPQ8N350 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CBARPQ8N350 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CBARPQ8N350 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CBARPQ8N350 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBARPQ8N350 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBARPQ8N350 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CBARPQ8N350 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBARPQ8N350 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBARPQ8N350 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBARPQ8N350 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBARPQ8N350 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBARPQ8N350 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBARPQ8N350 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBARPQ8N350 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBARPQ8N350 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBARPQ8N350 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBARPQ8N350 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBARPQ8N350 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBARPQ8N350 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBARPQ8N350 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBARPQ8N350 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBARPQ8N350 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBARPQ8N350 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBARPQ8N350 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBARPQ8N350 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBARPQ8N350 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBARPQ8N350 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBARPQ8N350 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBARPQ8N350 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBARPQ8N350 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBARPQ8N350 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBARPQ8N350 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBARPQ8N350 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBARPQ8N350 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CBARPQ8N350 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBARPQ8N350 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBARPQ8N350 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBARPQ8N350 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBARPQ8N350 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBARPQ8N350 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBARPQ8N350 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBARPQ8N350 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBARPQ8N350 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBARPQ8N350 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBARPQ8N350 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBARPQ8N350 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBARPQ8N350 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBARPQ8N350 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBARPQ8N350 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBARPQ8N350 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CBARPQ8N350 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBARPQ8N350 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBARPQ8N350 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBARPQ8N350 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms