Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC43Q8N309 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC43Q8N309 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC43Q8N309 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC43Q8N309 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC43Q8N309 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC43Q8N309 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC43Q8N309 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC43Q8N309 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC43Q8N309 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC43Q8N309 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC43Q8N309 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC43Q8N309 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC43Q8N309 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC43Q8N309 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC43Q8N309 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC43Q8N309 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC43Q8N309 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC43Q8N309 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC43Q8N309 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC43Q8N309 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC43Q8N309 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC43Q8N309 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC43Q8N309 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC43Q8N309 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC43Q8N309 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC43Q8N309 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC43Q8N309 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC43Q8N309 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC43Q8N309 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC43Q8N309 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC43Q8N309 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC43Q8N309 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC43Q8N309 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC43Q8N309 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC43Q8N309 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC43Q8N309 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC43Q8N309 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC43Q8N309 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC43Q8N309 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC43Q8N309 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms