Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUE6

HIST2H2AB, Histone H2A type 2-B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ABQ8IUE6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST2H2ABQ8IUE6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST2H2ABQ8IUE6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST2H2ABQ8IUE6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST2H2ABQ8IUE6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST2H2ABQ8IUE6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIST2H2ABQ8IUE6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ABQ8IUE6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ABQ8IUE6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ABQ8IUE6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ABQ8IUE6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ABQ8IUE6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2ABQ8IUE6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2ABQ8IUE6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ABQ8IUE6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ABQ8IUE6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ABQ8IUE6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST2H2ABQ8IUE6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST2H2ABQ8IUE6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ABQ8IUE6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ABQ8IUE6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIST2H2ABQ8IUE6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST2H2ABQ8IUE6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST2H2ABQ8IUE6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST2H2ABQ8IUE6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST2H2ABQ8IUE6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIST2H2ABQ8IUE6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIST2H2ABQ8IUE6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ABQ8IUE6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST2H2ABQ8IUE6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 907 ms