Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPAINQ86UA6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPAINQ86UA6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPAINQ86UA6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPAINQ86UA6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPAINQ86UA6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RPAINQ86UA6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPAINQ86UA6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAINQ86UA6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPAINQ86UA6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPAINQ86UA6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPAINQ86UA6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RPAINQ86UA6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RPAINQ86UA6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RPAINQ86UA6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RPAINQ86UA6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPAINQ86UA6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPAINQ86UA6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPAINQ86UA6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPAINQ86UA6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPAINQ86UA6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPAINQ86UA6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPAINQ86UA6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPAINQ86UA6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPAINQ86UA6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPAINQ86UA6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPAINQ86UA6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPAINQ86UA6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPAINQ86UA6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPAINQ86UA6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAINQ86UA6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RPAINQ86UA6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPAINQ86UA6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RPAINQ86UA6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPAINQ86UA6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPAINQ86UA6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPAINQ86UA6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPAINQ86UA6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPAINQ86UA6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPAINQ86UA6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPAINQ86UA6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPAINQ86UA6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPAINQ86UA6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPAINQ86UA6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAINQ86UA6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAINQ86UA6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAINQ86UA6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAINQ86UA6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPAINQ86UA6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPAINQ86UA6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPAINQ86UA6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPAINQ86UA6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPAINQ86UA6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RPAINQ86UA6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms