Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0Q8

RHOU, Rho-related GTP-binding protein RhoU, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOUQ7L0Q8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOUQ7L0Q8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOUQ7L0Q8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOUQ7L0Q8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOUQ7L0Q8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOUQ7L0Q8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOUQ7L0Q8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOUQ7L0Q8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOUQ7L0Q8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOUQ7L0Q8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOUQ7L0Q8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOUQ7L0Q8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOUQ7L0Q8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOUQ7L0Q8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOUQ7L0Q8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOUQ7L0Q8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOUQ7L0Q8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOUQ7L0Q8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOUQ7L0Q8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOUQ7L0Q8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOUQ7L0Q8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOUQ7L0Q8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOUQ7L0Q8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOUQ7L0Q8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOUQ7L0Q8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOUQ7L0Q8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOUQ7L0Q8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOUQ7L0Q8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOUQ7L0Q8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOUQ7L0Q8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOUQ7L0Q8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOUQ7L0Q8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOUQ7L0Q8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOUQ7L0Q8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOUQ7L0Q8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOUQ7L0Q8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOUQ7L0Q8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms