Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL4BQ6ZWI9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFPL4BQ6ZWI9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFPL4BQ6ZWI9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFPL4BQ6ZWI9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFPL4BQ6ZWI9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFPL4BQ6ZWI9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFPL4BQ6ZWI9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFPL4BQ6ZWI9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFPL4BQ6ZWI9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFPL4BQ6ZWI9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFPL4BQ6ZWI9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFPL4BQ6ZWI9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFPL4BQ6ZWI9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL4BQ6ZWI9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL4BQ6ZWI9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL4BQ6ZWI9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFPL4BQ6ZWI9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFPL4BQ6ZWI9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFPL4BQ6ZWI9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFPL4BQ6ZWI9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFPL4BQ6ZWI9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RFPL4BQ6ZWI9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFPL4BQ6ZWI9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFPL4BQ6ZWI9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFPL4BQ6ZWI9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RFPL4BQ6ZWI9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFPL4BQ6ZWI9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFPL4BQ6ZWI9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFPL4BQ6ZWI9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL4BQ6ZWI9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFPL4BQ6ZWI9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFPL4BQ6ZWI9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFPL4BQ6ZWI9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFPL4BQ6ZWI9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFPL4BQ6ZWI9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL4BQ6ZWI9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL4BQ6ZWI9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL4BQ6ZWI9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL4BQ6ZWI9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL4BQ6ZWI9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL4BQ6ZWI9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL4BQ6ZWI9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL4BQ6ZWI9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL4BQ6ZWI9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL4BQ6ZWI9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL4BQ6ZWI9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL4BQ6ZWI9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL4BQ6ZWI9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL4BQ6ZWI9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms