Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFX8Q6ZV50 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFX8Q6ZV50 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFX8Q6ZV50 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFX8Q6ZV50 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFX8Q6ZV50 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFX8Q6ZV50 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RFX8Q6ZV50 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFX8Q6ZV50 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFX8Q6ZV50 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFX8Q6ZV50 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFX8Q6ZV50 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFX8Q6ZV50 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFX8Q6ZV50 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFX8Q6ZV50 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFX8Q6ZV50 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFX8Q6ZV50 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX8Q6ZV50 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX8Q6ZV50 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX8Q6ZV50 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX8Q6ZV50 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX8Q6ZV50 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX8Q6ZV50 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX8Q6ZV50 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX8Q6ZV50 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX8Q6ZV50 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX8Q6ZV50 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX8Q6ZV50 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX8Q6ZV50 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX8Q6ZV50 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFX8Q6ZV50 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFX8Q6ZV50 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX8Q6ZV50 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX8Q6ZV50 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX8Q6ZV50 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX8Q6ZV50 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFX8Q6ZV50 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFX8Q6ZV50 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFX8Q6ZV50 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX8Q6ZV50 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX8Q6ZV50 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX8Q6ZV50 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFX8Q6ZV50 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFX8Q6ZV50 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFX8Q6ZV50 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX8Q6ZV50 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX8Q6ZV50 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX8Q6ZV50 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX8Q6ZV50 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX8Q6ZV50 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX8Q6ZV50 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX8Q6ZV50 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFX8Q6ZV50 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFX8Q6ZV50 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RFX8Q6ZV50 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX8Q6ZV50 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX8Q6ZV50 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX8Q6ZV50 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX8Q6ZV50 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX8Q6ZV50 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX8Q6ZV50 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX8Q6ZV50 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFX8Q6ZV50 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFX8Q6ZV50 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFX8Q6ZV50 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFX8Q6ZV50 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFX8Q6ZV50 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFX8Q6ZV50 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX8Q6ZV50 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RFX8Q6ZV50 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms