Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU64

CFAP65, Cilia- and flagella-associated protein 65, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP65Q6ZU64 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CFAP65Q6ZU64 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CFAP65Q6ZU64 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CFAP65Q6ZU64 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CFAP65Q6ZU64 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CFAP65Q6ZU64 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CFAP65Q6ZU64 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CFAP65Q6ZU64 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CFAP65Q6ZU64 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CFAP65Q6ZU64 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CFAP65Q6ZU64 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CFAP65Q6ZU64 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CFAP65Q6ZU64 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CFAP65Q6ZU64 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CFAP65Q6ZU64 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CFAP65Q6ZU64 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CFAP65Q6ZU64 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CFAP65Q6ZU64 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CFAP65Q6ZU64 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
CFAP65Q6ZU64 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CFAP65Q6ZU64 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CFAP65Q6ZU64 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CFAP65Q6ZU64 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CFAP65Q6ZU64 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
CFAP65Q6ZU64 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CFAP65Q6ZU64 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CFAP65Q6ZU64 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CFAP65Q6ZU64 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CFAP65Q6ZU64 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CFAP65Q6ZU64 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CFAP65Q6ZU64 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CFAP65Q6ZU64 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CFAP65Q6ZU64 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CFAP65Q6ZU64 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CFAP65Q6ZU64 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CFAP65Q6ZU64 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CFAP65Q6ZU64 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CFAP65Q6ZU64 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CFAP65Q6ZU64 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CFAP65Q6ZU64 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CFAP65Q6ZU64 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CFAP65Q6ZU64 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CFAP65Q6ZU64 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CFAP65Q6ZU64 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CFAP65Q6ZU64 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CFAP65Q6ZU64 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CFAP65Q6ZU64 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CFAP65Q6ZU64 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CFAP65Q6ZU64 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CFAP65Q6ZU64 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CFAP65Q6ZU64 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.05■■■■■ 4
CFAP65Q6ZU64 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CFAP65Q6ZU64 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CFAP65Q6ZU64 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CFAP65Q6ZU64 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CFAP65Q6ZU64 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
CFAP65Q6ZU64 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
CFAP65Q6ZU64 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■□ 3.99
CFAP65Q6ZU64 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CFAP65Q6ZU64 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CFAP65Q6ZU64 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CFAP65Q6ZU64 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CFAP65Q6ZU64 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
CFAP65Q6ZU64 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CFAP65Q6ZU64 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
CFAP65Q6ZU64 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CFAP65Q6ZU64 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CFAP65Q6ZU64 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CFAP65Q6ZU64 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
CFAP65Q6ZU64 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CFAP65Q6ZU64 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CFAP65Q6ZU64 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
CFAP65Q6ZU64 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
CFAP65Q6ZU64 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CFAP65Q6ZU64 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CFAP65Q6ZU64 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CFAP65Q6ZU64 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CFAP65Q6ZU64 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CFAP65Q6ZU64 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CFAP65Q6ZU64 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CFAP65Q6ZU64 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CFAP65Q6ZU64 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
CFAP65Q6ZU64 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
CFAP65Q6ZU64 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CFAP65Q6ZU64 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CFAP65Q6ZU64 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CFAP65Q6ZU64 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CFAP65Q6ZU64 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CFAP65Q6ZU64 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CFAP65Q6ZU64 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CFAP65Q6ZU64 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CFAP65Q6ZU64 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CFAP65Q6ZU64 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CFAP65Q6ZU64 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CFAP65Q6ZU64 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
CFAP65Q6ZU64 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CFAP65Q6ZU64 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
CFAP65Q6ZU64 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CFAP65Q6ZU64 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CFAP65Q6ZU64 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms