Protein–RNA interactions for Protein: Q6T423

SLC22A25, Solute carrier family 22 member 25, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A25Q6T423 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A25Q6T423 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A25Q6T423 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A25Q6T423 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A25Q6T423 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A25Q6T423 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC22A25Q6T423 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC22A25Q6T423 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A25Q6T423 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A25Q6T423 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A25Q6T423 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A25Q6T423 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A25Q6T423 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A25Q6T423 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A25Q6T423 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC22A25Q6T423 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A25Q6T423 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A25Q6T423 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC22A25Q6T423 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A25Q6T423 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A25Q6T423 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A25Q6T423 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A25Q6T423 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A25Q6T423 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A25Q6T423 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A25Q6T423 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A25Q6T423 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A25Q6T423 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A25Q6T423 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A25Q6T423 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A25Q6T423 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms