Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLC3Q6P597 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLC3Q6P597 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KLC3Q6P597 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLC3Q6P597 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLC3Q6P597 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLC3Q6P597 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLC3Q6P597 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLC3Q6P597 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLC3Q6P597 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLC3Q6P597 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLC3Q6P597 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLC3Q6P597 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLC3Q6P597 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLC3Q6P597 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLC3Q6P597 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLC3Q6P597 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLC3Q6P597 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLC3Q6P597 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLC3Q6P597 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KLC3Q6P597 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLC3Q6P597 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLC3Q6P597 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLC3Q6P597 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLC3Q6P597 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLC3Q6P597 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLC3Q6P597 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLC3Q6P597 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLC3Q6P597 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLC3Q6P597 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLC3Q6P597 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLC3Q6P597 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLC3Q6P597 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLC3Q6P597 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLC3Q6P597 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLC3Q6P597 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLC3Q6P597 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLC3Q6P597 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLC3Q6P597 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KLC3Q6P597 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms