Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCN8Q6JVE9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCN8Q6JVE9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCN8Q6JVE9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCN8Q6JVE9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCN8Q6JVE9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCN8Q6JVE9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCN8Q6JVE9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCN8Q6JVE9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCN8Q6JVE9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCN8Q6JVE9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCN8Q6JVE9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LCN8Q6JVE9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCN8Q6JVE9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCN8Q6JVE9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCN8Q6JVE9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCN8Q6JVE9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCN8Q6JVE9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCN8Q6JVE9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCN8Q6JVE9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCN8Q6JVE9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCN8Q6JVE9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCN8Q6JVE9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCN8Q6JVE9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCN8Q6JVE9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCN8Q6JVE9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCN8Q6JVE9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCN8Q6JVE9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCN8Q6JVE9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCN8Q6JVE9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCN8Q6JVE9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCN8Q6JVE9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCN8Q6JVE9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCN8Q6JVE9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCN8Q6JVE9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCN8Q6JVE9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCN8Q6JVE9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCN8Q6JVE9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCN8Q6JVE9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCN8Q6JVE9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCN8Q6JVE9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCN8Q6JVE9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCN8Q6JVE9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCN8Q6JVE9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCN8Q6JVE9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCN8Q6JVE9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCN8Q6JVE9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCN8Q6JVE9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCN8Q6JVE9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCN8Q6JVE9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCN8Q6JVE9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCN8Q6JVE9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCN8Q6JVE9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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