Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LCN8Q6JVE9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LCN8Q6JVE9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LCN8Q6JVE9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LCN8Q6JVE9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LCN8Q6JVE9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LCN8Q6JVE9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
LCN8Q6JVE9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LCN8Q6JVE9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LCN8Q6JVE9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
LCN8Q6JVE9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LCN8Q6JVE9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
LCN8Q6JVE9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
LCN8Q6JVE9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LCN8Q6JVE9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LCN8Q6JVE9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LCN8Q6JVE9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LCN8Q6JVE9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LCN8Q6JVE9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LCN8Q6JVE9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LCN8Q6JVE9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LCN8Q6JVE9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LCN8Q6JVE9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LCN8Q6JVE9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LCN8Q6JVE9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LCN8Q6JVE9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LCN8Q6JVE9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LCN8Q6JVE9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LCN8Q6JVE9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LCN8Q6JVE9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LCN8Q6JVE9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LCN8Q6JVE9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LCN8Q6JVE9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LCN8Q6JVE9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LCN8Q6JVE9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LCN8Q6JVE9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LCN8Q6JVE9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LCN8Q6JVE9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LCN8Q6JVE9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LCN8Q6JVE9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LCN8Q6JVE9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCN8Q6JVE9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCN8Q6JVE9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LCN8Q6JVE9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LCN8Q6JVE9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LCN8Q6JVE9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LCN8Q6JVE9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LCN8Q6JVE9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LCN8Q6JVE9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LCN8Q6JVE9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LCN8Q6JVE9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LCN8Q6JVE9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LCN8Q6JVE9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LCN8Q6JVE9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCN8Q6JVE9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCN8Q6JVE9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCN8Q6JVE9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCN8Q6JVE9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LCN8Q6JVE9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCN8Q6JVE9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCN8Q6JVE9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCN8Q6JVE9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCN8Q6JVE9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LCN8Q6JVE9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LCN8Q6JVE9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCN8Q6JVE9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCN8Q6JVE9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCN8Q6JVE9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCN8Q6JVE9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCN8Q6JVE9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LCN8Q6JVE9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LCN8Q6JVE9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCN8Q6JVE9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCN8Q6JVE9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LCN8Q6JVE9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LCN8Q6JVE9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LCN8Q6JVE9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LCN8Q6JVE9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LCN8Q6JVE9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LCN8Q6JVE9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LCN8Q6JVE9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LCN8Q6JVE9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LCN8Q6JVE9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LCN8Q6JVE9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LCN8Q6JVE9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LCN8Q6JVE9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LCN8Q6JVE9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LCN8Q6JVE9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LCN8Q6JVE9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LCN8Q6JVE9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LCN8Q6JVE9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LCN8Q6JVE9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LCN8Q6JVE9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LCN8Q6JVE9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LCN8Q6JVE9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LCN8Q6JVE9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LCN8Q6JVE9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCN8Q6JVE9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LCN8Q6JVE9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LCN8Q6JVE9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms