Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLIPQ5VWP3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLIPQ5VWP3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLIPQ5VWP3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLIPQ5VWP3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLIPQ5VWP3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLIPQ5VWP3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
MLIPQ5VWP3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MLIPQ5VWP3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MLIPQ5VWP3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MLIPQ5VWP3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MLIPQ5VWP3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MLIPQ5VWP3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MLIPQ5VWP3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MLIPQ5VWP3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MLIPQ5VWP3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MLIPQ5VWP3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MLIPQ5VWP3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MLIPQ5VWP3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MLIPQ5VWP3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MLIPQ5VWP3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MLIPQ5VWP3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MLIPQ5VWP3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MLIPQ5VWP3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MLIPQ5VWP3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MLIPQ5VWP3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLIPQ5VWP3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLIPQ5VWP3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MLIPQ5VWP3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MLIPQ5VWP3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MLIPQ5VWP3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLIPQ5VWP3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MLIPQ5VWP3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLIPQ5VWP3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLIPQ5VWP3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLIPQ5VWP3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MLIPQ5VWP3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLIPQ5VWP3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLIPQ5VWP3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLIPQ5VWP3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MLIPQ5VWP3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLIPQ5VWP3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLIPQ5VWP3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLIPQ5VWP3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MLIPQ5VWP3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms