Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DEPDC1Q5TB30 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DEPDC1Q5TB30 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DEPDC1Q5TB30 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DEPDC1Q5TB30 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DEPDC1Q5TB30 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DEPDC1Q5TB30 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DEPDC1Q5TB30 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEPDC1Q5TB30 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEPDC1Q5TB30 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEPDC1Q5TB30 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DEPDC1Q5TB30 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DEPDC1Q5TB30 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEPDC1Q5TB30 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEPDC1Q5TB30 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DEPDC1Q5TB30 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DEPDC1Q5TB30 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEPDC1Q5TB30 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DEPDC1Q5TB30 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEPDC1Q5TB30 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DEPDC1Q5TB30 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DEPDC1Q5TB30 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DEPDC1Q5TB30 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DEPDC1Q5TB30 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DEPDC1Q5TB30 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DEPDC1Q5TB30 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DEPDC1Q5TB30 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DEPDC1Q5TB30 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DEPDC1Q5TB30 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DEPDC1Q5TB30 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DEPDC1Q5TB30 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DEPDC1Q5TB30 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEPDC1Q5TB30 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEPDC1Q5TB30 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEPDC1Q5TB30 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEPDC1Q5TB30 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DEPDC1Q5TB30 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DEPDC1Q5TB30 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DEPDC1Q5TB30 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DEPDC1Q5TB30 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DEPDC1Q5TB30 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DEPDC1Q5TB30 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DEPDC1Q5TB30 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DEPDC1Q5TB30 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DEPDC1Q5TB30 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DEPDC1Q5TB30 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DEPDC1Q5TB30 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DEPDC1Q5TB30 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DEPDC1Q5TB30 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DEPDC1Q5TB30 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DEPDC1Q5TB30 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DEPDC1Q5TB30 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DEPDC1Q5TB30 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DEPDC1Q5TB30 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DEPDC1Q5TB30 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DEPDC1Q5TB30 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DEPDC1Q5TB30 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DEPDC1Q5TB30 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DEPDC1Q5TB30 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DEPDC1Q5TB30 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DEPDC1Q5TB30 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEPDC1Q5TB30 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEPDC1Q5TB30 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DEPDC1Q5TB30 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DEPDC1Q5TB30 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEPDC1Q5TB30 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEPDC1Q5TB30 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEPDC1Q5TB30 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DEPDC1Q5TB30 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DEPDC1Q5TB30 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms