Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CCDC18Q5T9S5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CCDC18Q5T9S5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CCDC18Q5T9S5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CCDC18Q5T9S5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CCDC18Q5T9S5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CCDC18Q5T9S5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CCDC18Q5T9S5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CCDC18Q5T9S5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CCDC18Q5T9S5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC18Q5T9S5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC18Q5T9S5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC18Q5T9S5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CCDC18Q5T9S5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CCDC18Q5T9S5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CCDC18Q5T9S5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CCDC18Q5T9S5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
CCDC18Q5T9S5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CCDC18Q5T9S5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CCDC18Q5T9S5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms