Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00303Q3SY05 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00303Q3SY05 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC00303Q3SY05 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC00303Q3SY05 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00303Q3SY05 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00303Q3SY05 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC00303Q3SY05 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC00303Q3SY05 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00303Q3SY05 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC00303Q3SY05 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00303Q3SY05 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00303Q3SY05 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00303Q3SY05 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC00303Q3SY05 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00303Q3SY05 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC00303Q3SY05 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00303Q3SY05 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00303Q3SY05 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00303Q3SY05 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00303Q3SY05 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00303Q3SY05 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00303Q3SY05 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00303Q3SY05 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00303Q3SY05 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00303Q3SY05 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00303Q3SY05 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00303Q3SY05 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00303Q3SY05 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00303Q3SY05 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00303Q3SY05 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00303Q3SY05 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00303Q3SY05 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00303Q3SY05 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00303Q3SY05 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00303Q3SY05 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00303Q3SY05 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00303Q3SY05 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00303Q3SY05 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00303Q3SY05 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00303Q3SY05 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00303Q3SY05 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00303Q3SY05 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00303Q3SY05 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00303Q3SY05 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00303Q3SY05 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00303Q3SY05 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00303Q3SY05 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00303Q3SY05 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00303Q3SY05 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00303Q3SY05 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00303Q3SY05 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00303Q3SY05 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00303Q3SY05 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00303Q3SY05 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00303Q3SY05 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00303Q3SY05 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00303Q3SY05 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00303Q3SY05 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00303Q3SY05 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00303Q3SY05 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00303Q3SY05 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00303Q3SY05 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00303Q3SY05 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00303Q3SY05 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00303Q3SY05 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00303Q3SY05 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00303Q3SY05 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00303Q3SY05 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00303Q3SY05 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00303Q3SY05 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms