Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
KLHL40Q2TBA0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
KLHL40Q2TBA0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KLHL40Q2TBA0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KLHL40Q2TBA0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KLHL40Q2TBA0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
KLHL40Q2TBA0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
KLHL40Q2TBA0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KLHL40Q2TBA0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
KLHL40Q2TBA0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KLHL40Q2TBA0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KLHL40Q2TBA0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
KLHL40Q2TBA0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KLHL40Q2TBA0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KLHL40Q2TBA0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KLHL40Q2TBA0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KLHL40Q2TBA0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KLHL40Q2TBA0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KLHL40Q2TBA0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KLHL40Q2TBA0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KLHL40Q2TBA0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KLHL40Q2TBA0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
KLHL40Q2TBA0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KLHL40Q2TBA0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KLHL40Q2TBA0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KLHL40Q2TBA0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KLHL40Q2TBA0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KLHL40Q2TBA0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KLHL40Q2TBA0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KLHL40Q2TBA0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KLHL40Q2TBA0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KLHL40Q2TBA0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KLHL40Q2TBA0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KLHL40Q2TBA0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KLHL40Q2TBA0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KLHL40Q2TBA0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KLHL40Q2TBA0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KLHL40Q2TBA0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KLHL40Q2TBA0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KLHL40Q2TBA0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
KLHL40Q2TBA0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
KLHL40Q2TBA0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KLHL40Q2TBA0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
KLHL40Q2TBA0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KLHL40Q2TBA0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KLHL40Q2TBA0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KLHL40Q2TBA0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KLHL40Q2TBA0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KLHL40Q2TBA0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KLHL40Q2TBA0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KLHL40Q2TBA0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KLHL40Q2TBA0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KLHL40Q2TBA0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KLHL40Q2TBA0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KLHL40Q2TBA0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KLHL40Q2TBA0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KLHL40Q2TBA0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KLHL40Q2TBA0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KLHL40Q2TBA0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
KLHL40Q2TBA0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KLHL40Q2TBA0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KLHL40Q2TBA0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KLHL40Q2TBA0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KLHL40Q2TBA0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KLHL40Q2TBA0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KLHL40Q2TBA0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KLHL40Q2TBA0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KLHL40Q2TBA0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KLHL40Q2TBA0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KLHL40Q2TBA0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KLHL40Q2TBA0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KLHL40Q2TBA0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms