Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IMPG1Q17R60 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IMPG1Q17R60 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IMPG1Q17R60 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IMPG1Q17R60 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IMPG1Q17R60 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IMPG1Q17R60 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IMPG1Q17R60 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IMPG1Q17R60 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IMPG1Q17R60 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IMPG1Q17R60 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IMPG1Q17R60 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IMPG1Q17R60 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IMPG1Q17R60 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IMPG1Q17R60 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IMPG1Q17R60 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IMPG1Q17R60 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IMPG1Q17R60 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IMPG1Q17R60 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IMPG1Q17R60 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IMPG1Q17R60 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IMPG1Q17R60 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IMPG1Q17R60 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IMPG1Q17R60 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IMPG1Q17R60 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IMPG1Q17R60 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IMPG1Q17R60 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IMPG1Q17R60 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IMPG1Q17R60 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IMPG1Q17R60 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IMPG1Q17R60 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IMPG1Q17R60 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IMPG1Q17R60 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IMPG1Q17R60 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IMPG1Q17R60 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IMPG1Q17R60 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IMPG1Q17R60 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IMPG1Q17R60 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IMPG1Q17R60 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IMPG1Q17R60 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IMPG1Q17R60 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IMPG1Q17R60 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IMPG1Q17R60 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IMPG1Q17R60 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IMPG1Q17R60 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IMPG1Q17R60 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IMPG1Q17R60 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IMPG1Q17R60 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IMPG1Q17R60 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IMPG1Q17R60 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IMPG1Q17R60 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IMPG1Q17R60 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
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