Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDUFA9Q16795 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NDUFA9Q16795 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDUFA9Q16795 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDUFA9Q16795 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDUFA9Q16795 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDUFA9Q16795 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDUFA9Q16795 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDUFA9Q16795 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDUFA9Q16795 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDUFA9Q16795 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDUFA9Q16795 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NDUFA9Q16795 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDUFA9Q16795 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDUFA9Q16795 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDUFA9Q16795 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDUFA9Q16795 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDUFA9Q16795 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFA9Q16795 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFA9Q16795 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFA9Q16795 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFA9Q16795 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFA9Q16795 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFA9Q16795 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDUFA9Q16795 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NDUFA9Q16795 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDUFA9Q16795 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDUFA9Q16795 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDUFA9Q16795 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDUFA9Q16795 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDUFA9Q16795 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDUFA9Q16795 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFA9Q16795 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFA9Q16795 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDUFA9Q16795 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDUFA9Q16795 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NDUFA9Q16795 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDUFA9Q16795 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDUFA9Q16795 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFA9Q16795 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFA9Q16795 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFA9Q16795 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFA9Q16795 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDUFA9Q16795 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDUFA9Q16795 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDUFA9Q16795 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDUFA9Q16795 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFA9Q16795 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFA9Q16795 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFA9Q16795 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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