Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP7Q16576 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP7Q16576 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP7Q16576 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBBP7Q16576 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBBP7Q16576 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBBP7Q16576 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBBP7Q16576 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBBP7Q16576 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBBP7Q16576 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBBP7Q16576 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBBP7Q16576 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBBP7Q16576 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBBP7Q16576 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBBP7Q16576 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBBP7Q16576 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBBP7Q16576 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBBP7Q16576 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBBP7Q16576 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBBP7Q16576 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBBP7Q16576 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBBP7Q16576 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBBP7Q16576 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBBP7Q16576 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBBP7Q16576 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP7Q16576 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP7Q16576 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP7Q16576 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBBP7Q16576 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP7Q16576 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP7Q16576 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP7Q16576 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP7Q16576 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP7Q16576 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP7Q16576 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RBBP7Q16576 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RBBP7Q16576 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP7Q16576 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP7Q16576 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP7Q16576 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP7Q16576 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP7Q16576 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP7Q16576 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP7Q16576 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP7Q16576 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP7Q16576 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBBP7Q16576 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP7Q16576 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP7Q16576 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP7Q16576 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBBP7Q16576 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBBP7Q16576 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBBP7Q16576 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBBP7Q16576 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBBP7Q16576 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBBP7Q16576 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBBP7Q16576 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBBP7Q16576 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBBP7Q16576 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBBP7Q16576 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBBP7Q16576 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP7Q16576 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP7Q16576 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP7Q16576 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP7Q16576 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP7Q16576 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBBP7Q16576 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP7Q16576 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP7Q16576 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP7Q16576 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP7Q16576 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP7Q16576 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP7Q16576 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms