Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ANKRD1Q15327 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ANKRD1Q15327 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ANKRD1Q15327 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ANKRD1Q15327 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ANKRD1Q15327 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ANKRD1Q15327 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ANKRD1Q15327 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ANKRD1Q15327 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ANKRD1Q15327 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ANKRD1Q15327 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ANKRD1Q15327 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ANKRD1Q15327 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ANKRD1Q15327 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ANKRD1Q15327 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ANKRD1Q15327 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ANKRD1Q15327 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ANKRD1Q15327 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ANKRD1Q15327 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ANKRD1Q15327 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ANKRD1Q15327 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ANKRD1Q15327 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ANKRD1Q15327 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ANKRD1Q15327 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ANKRD1Q15327 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ANKRD1Q15327 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ANKRD1Q15327 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ANKRD1Q15327 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ANKRD1Q15327 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ANKRD1Q15327 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ANKRD1Q15327 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ANKRD1Q15327 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ANKRD1Q15327 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ANKRD1Q15327 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ANKRD1Q15327 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ANKRD1Q15327 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ANKRD1Q15327 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
ANKRD1Q15327 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ANKRD1Q15327 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ANKRD1Q15327 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ANKRD1Q15327 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ANKRD1Q15327 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
ANKRD1Q15327 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ANKRD1Q15327 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ANKRD1Q15327 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ANKRD1Q15327 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ANKRD1Q15327 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ANKRD1Q15327 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ANKRD1Q15327 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ANKRD1Q15327 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ANKRD1Q15327 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ANKRD1Q15327 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ANKRD1Q15327 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
ANKRD1Q15327 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ANKRD1Q15327 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ANKRD1Q15327 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ANKRD1Q15327 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ANKRD1Q15327 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ANKRD1Q15327 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ANKRD1Q15327 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ANKRD1Q15327 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ANKRD1Q15327 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ANKRD1Q15327 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ANKRD1Q15327 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ANKRD1Q15327 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ANKRD1Q15327 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ANKRD1Q15327 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ANKRD1Q15327 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ANKRD1Q15327 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ANKRD1Q15327 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ANKRD1Q15327 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ANKRD1Q15327 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ANKRD1Q15327 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ANKRD1Q15327 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ANKRD1Q15327 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ANKRD1Q15327 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ANKRD1Q15327 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ANKRD1Q15327 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ANKRD1Q15327 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ANKRD1Q15327 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms