Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
PTPRKQ15262 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
PTPRKQ15262 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
PTPRKQ15262 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
PTPRKQ15262 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
PTPRKQ15262 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PTPRKQ15262 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PTPRKQ15262 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
PTPRKQ15262 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
PTPRKQ15262 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PTPRKQ15262 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PTPRKQ15262 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
PTPRKQ15262 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
PTPRKQ15262 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PTPRKQ15262 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.23
PTPRKQ15262 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
PTPRKQ15262 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
PTPRKQ15262 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
PTPRKQ15262 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
PTPRKQ15262 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PTPRKQ15262 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
PTPRKQ15262 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PTPRKQ15262 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
PTPRKQ15262 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PTPRKQ15262 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PTPRKQ15262 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PTPRKQ15262 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PTPRKQ15262 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PTPRKQ15262 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PTPRKQ15262 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
PTPRKQ15262 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
PTPRKQ15262 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
PTPRKQ15262 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PTPRKQ15262 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PTPRKQ15262 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PTPRKQ15262 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PTPRKQ15262 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PTPRKQ15262 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PTPRKQ15262 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PTPRKQ15262 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PTPRKQ15262 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
PTPRKQ15262 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
PTPRKQ15262 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PTPRKQ15262 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PTPRKQ15262 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
PTPRKQ15262 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PTPRKQ15262 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PTPRKQ15262 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PTPRKQ15262 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PTPRKQ15262 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PTPRKQ15262 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PTPRKQ15262 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PTPRKQ15262 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PTPRKQ15262 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PTPRKQ15262 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
PTPRKQ15262 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PTPRKQ15262 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PTPRKQ15262 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
PTPRKQ15262 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
PTPRKQ15262 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PTPRKQ15262 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PTPRKQ15262 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PTPRKQ15262 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PTPRKQ15262 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PTPRKQ15262 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PTPRKQ15262 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
PTPRKQ15262 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
PTPRKQ15262 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
PTPRKQ15262 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PTPRKQ15262 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PTPRKQ15262 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PTPRKQ15262 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PTPRKQ15262 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PTPRKQ15262 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
PTPRKQ15262 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
PTPRKQ15262 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
PTPRKQ15262 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PTPRKQ15262 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PTPRKQ15262 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
PTPRKQ15262 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PTPRKQ15262 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PTPRKQ15262 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PTPRKQ15262 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PTPRKQ15262 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PTPRKQ15262 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
PTPRKQ15262 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
PTPRKQ15262 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PTPRKQ15262 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
PTPRKQ15262 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PTPRKQ15262 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PTPRKQ15262 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PTPRKQ15262 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PTPRKQ15262 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.87■■■■■ 4.13
PTPRKQ15262 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
PTPRKQ15262 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PTPRKQ15262 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PTPRKQ15262 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PTPRKQ15262 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PTPRKQ15262 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PTPRKQ15262 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
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