Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SHPRHQ149N8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SHPRHQ149N8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SHPRHQ149N8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SHPRHQ149N8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SHPRHQ149N8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SHPRHQ149N8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SHPRHQ149N8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SHPRHQ149N8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SHPRHQ149N8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SHPRHQ149N8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
SHPRHQ149N8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SHPRHQ149N8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SHPRHQ149N8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SHPRHQ149N8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SHPRHQ149N8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
SHPRHQ149N8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
SHPRHQ149N8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SHPRHQ149N8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
SHPRHQ149N8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SHPRHQ149N8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SHPRHQ149N8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SHPRHQ149N8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SHPRHQ149N8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SHPRHQ149N8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SHPRHQ149N8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHPRHQ149N8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SHPRHQ149N8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SHPRHQ149N8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SHPRHQ149N8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SHPRHQ149N8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SHPRHQ149N8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SHPRHQ149N8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SHPRHQ149N8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SHPRHQ149N8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SHPRHQ149N8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SHPRHQ149N8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SHPRHQ149N8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SHPRHQ149N8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SHPRHQ149N8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SHPRHQ149N8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
SHPRHQ149N8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SHPRHQ149N8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SHPRHQ149N8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SHPRHQ149N8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
SHPRHQ149N8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
SHPRHQ149N8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SHPRHQ149N8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SHPRHQ149N8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SHPRHQ149N8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SHPRHQ149N8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SHPRHQ149N8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SHPRHQ149N8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
SHPRHQ149N8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
SHPRHQ149N8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SHPRHQ149N8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SHPRHQ149N8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHPRHQ149N8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHPRHQ149N8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
SHPRHQ149N8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SHPRHQ149N8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SHPRHQ149N8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
SHPRHQ149N8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SHPRHQ149N8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SHPRHQ149N8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SHPRHQ149N8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SHPRHQ149N8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SHPRHQ149N8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SHPRHQ149N8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
SHPRHQ149N8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
SHPRHQ149N8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SHPRHQ149N8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SHPRHQ149N8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SHPRHQ149N8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SHPRHQ149N8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SHPRHQ149N8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SHPRHQ149N8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SHPRHQ149N8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SHPRHQ149N8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SHPRHQ149N8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SHPRHQ149N8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SHPRHQ149N8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
SHPRHQ149N8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
SHPRHQ149N8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SHPRHQ149N8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SHPRHQ149N8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
SHPRHQ149N8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SHPRHQ149N8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SHPRHQ149N8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHPRHQ149N8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHPRHQ149N8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SHPRHQ149N8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SHPRHQ149N8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SHPRHQ149N8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SHPRHQ149N8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SHPRHQ149N8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SHPRHQ149N8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
SHPRHQ149N8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
SHPRHQ149N8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SHPRHQ149N8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
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