Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1D2Q14995 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1D2Q14995 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1D2Q14995 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1D2Q14995 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1D2Q14995 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1D2Q14995 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1D2Q14995 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1D2Q14995 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1D2Q14995 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1D2Q14995 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1D2Q14995 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1D2Q14995 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1D2Q14995 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1D2Q14995 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1D2Q14995 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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