Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFBQ13951 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBFBQ13951 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBFBQ13951 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CBFBQ13951 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFBQ13951 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBFBQ13951 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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