Protein–RNA interactions for Protein: Q13907

IDI1, Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDI1Q13907 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
IDI1Q13907 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
IDI1Q13907 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
IDI1Q13907 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
IDI1Q13907 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
IDI1Q13907 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
IDI1Q13907 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
IDI1Q13907 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
IDI1Q13907 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
IDI1Q13907 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
IDI1Q13907 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
IDI1Q13907 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
IDI1Q13907 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
IDI1Q13907 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
IDI1Q13907 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
IDI1Q13907 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
IDI1Q13907 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
IDI1Q13907 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
IDI1Q13907 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
IDI1Q13907 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.97■■■■□ 3.99
IDI1Q13907 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
IDI1Q13907 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
IDI1Q13907 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
IDI1Q13907 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
IDI1Q13907 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.93■■■■□ 3.98
IDI1Q13907 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
IDI1Q13907 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
IDI1Q13907 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
IDI1Q13907 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
IDI1Q13907 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
IDI1Q13907 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
IDI1Q13907 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
IDI1Q13907 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
IDI1Q13907 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
IDI1Q13907 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
IDI1Q13907 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
IDI1Q13907 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
IDI1Q13907 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
IDI1Q13907 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
IDI1Q13907 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
IDI1Q13907 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
IDI1Q13907 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
IDI1Q13907 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
IDI1Q13907 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
IDI1Q13907 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
IDI1Q13907 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
IDI1Q13907 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.71■■■■□ 3.95
IDI1Q13907 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
IDI1Q13907 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
IDI1Q13907 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
IDI1Q13907 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
IDI1Q13907 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
IDI1Q13907 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
IDI1Q13907 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
IDI1Q13907 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
IDI1Q13907 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
IDI1Q13907 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.66■■■■□ 3.94
IDI1Q13907 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
IDI1Q13907 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
IDI1Q13907 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
IDI1Q13907 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
IDI1Q13907 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
IDI1Q13907 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
IDI1Q13907 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
IDI1Q13907 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
IDI1Q13907 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
IDI1Q13907 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
IDI1Q13907 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
IDI1Q13907 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
IDI1Q13907 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
IDI1Q13907 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
IDI1Q13907 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
IDI1Q13907 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
IDI1Q13907 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
IDI1Q13907 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
IDI1Q13907 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
IDI1Q13907 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
IDI1Q13907 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
IDI1Q13907 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
IDI1Q13907 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
IDI1Q13907 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
IDI1Q13907 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
IDI1Q13907 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
IDI1Q13907 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
IDI1Q13907 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
IDI1Q13907 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.33■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
IDI1Q13907 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms