Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTM1Q13496 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTM1Q13496 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTM1Q13496 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTM1Q13496 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTM1Q13496 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTM1Q13496 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTM1Q13496 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTM1Q13496 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTM1Q13496 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTM1Q13496 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTM1Q13496 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTM1Q13496 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTM1Q13496 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTM1Q13496 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTM1Q13496 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTM1Q13496 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTM1Q13496 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MTM1Q13496 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTM1Q13496 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTM1Q13496 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTM1Q13496 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTM1Q13496 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTM1Q13496 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTM1Q13496 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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MTM1Q13496 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTM1Q13496 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTM1Q13496 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTM1Q13496 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTM1Q13496 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTM1Q13496 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTM1Q13496 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTM1Q13496 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTM1Q13496 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTM1Q13496 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTM1Q13496 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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MTM1Q13496 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTM1Q13496 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
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MTM1Q13496 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTM1Q13496 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MTM1Q13496 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MTM1Q13496 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
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