Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP3AQ13472 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP3AQ13472 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP3AQ13472 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3AQ13472 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3AQ13472 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP3AQ13472 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP3AQ13472 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TOP3AQ13472 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP3AQ13472 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP3AQ13472 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP3AQ13472 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms