Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NFX1Q12986 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFX1Q12986 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NFX1Q12986 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFX1Q12986 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NFX1Q12986 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFX1Q12986 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFX1Q12986 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFX1Q12986 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFX1Q12986 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFX1Q12986 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFX1Q12986 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFX1Q12986 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFX1Q12986 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFX1Q12986 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFX1Q12986 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFX1Q12986 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NFX1Q12986 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFX1Q12986 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NFX1Q12986 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NFX1Q12986 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFX1Q12986 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFX1Q12986 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFX1Q12986 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFX1Q12986 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NFX1Q12986 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFX1Q12986 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NFX1Q12986 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NFX1Q12986 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NFX1Q12986 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFX1Q12986 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFX1Q12986 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFX1Q12986 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFX1Q12986 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFX1Q12986 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFX1Q12986 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFX1Q12986 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFX1Q12986 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFX1Q12986 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
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