Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FAAP100Q0VG06 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FAAP100Q0VG06 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FAAP100Q0VG06 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FAAP100Q0VG06 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FAAP100Q0VG06 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FAAP100Q0VG06 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FAAP100Q0VG06 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FAAP100Q0VG06 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FAAP100Q0VG06 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FAAP100Q0VG06 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FAAP100Q0VG06 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FAAP100Q0VG06 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FAAP100Q0VG06 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FAAP100Q0VG06 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
FAAP100Q0VG06 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
FAAP100Q0VG06 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FAAP100Q0VG06 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FAAP100Q0VG06 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FAAP100Q0VG06 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FAAP100Q0VG06 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAAP100Q0VG06 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FAAP100Q0VG06 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAAP100Q0VG06 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms