Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC47.6■■■■■ 5.21
ABCC8Q09428 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
ABCC8Q09428 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
ABCC8Q09428 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC47.53■■■■■ 5.2
ABCC8Q09428 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
ABCC8Q09428 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
ABCC8Q09428 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC47.51■■■■■ 5.2
ABCC8Q09428 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.5■■■■■ 5.19
ABCC8Q09428 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC47.49■■■■■ 5.19
ABCC8Q09428 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
ABCC8Q09428 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC47.47■■■■■ 5.19
ABCC8Q09428 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC47.45■■■■■ 5.19
ABCC8Q09428 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
ABCC8Q09428 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
ABCC8Q09428 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
ABCC8Q09428 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC47.38■■■■■ 5.18
ABCC8Q09428 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
ABCC8Q09428 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
ABCC8Q09428 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
ABCC8Q09428 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
ABCC8Q09428 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
ABCC8Q09428 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
ABCC8Q09428 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
ABCC8Q09428 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.24■■■■■ 5.15
ABCC8Q09428 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
ABCC8Q09428 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.23■■■■■ 5.15
ABCC8Q09428 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC47.22■■■■■ 5.15
ABCC8Q09428 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
ABCC8Q09428 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
ABCC8Q09428 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
ABCC8Q09428 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC47.2■■■■■ 5.15
ABCC8Q09428 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
ABCC8Q09428 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
ABCC8Q09428 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
ABCC8Q09428 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
ABCC8Q09428 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
ABCC8Q09428 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC47.14■■■■■ 5.14
ABCC8Q09428 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
ABCC8Q09428 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
ABCC8Q09428 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC47.11■■■■■ 5.13
ABCC8Q09428 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
ABCC8Q09428 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
ABCC8Q09428 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC47.08■■■■■ 5.13
ABCC8Q09428 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
ABCC8Q09428 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
ABCC8Q09428 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
ABCC8Q09428 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC47.03■■■■■ 5.12
ABCC8Q09428 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC47.02■■■■■ 5.12
ABCC8Q09428 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
ABCC8Q09428 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
ABCC8Q09428 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
ABCC8Q09428 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
ABCC8Q09428 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC47■■■■■ 5.11
ABCC8Q09428 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC46.98■■■■■ 5.11
ABCC8Q09428 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
ABCC8Q09428 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
ABCC8Q09428 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
ABCC8Q09428 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
ABCC8Q09428 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
ABCC8Q09428 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
ABCC8Q09428 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
ABCC8Q09428 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.11
ABCC8Q09428 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC46.92■■■■■ 5.1
ABCC8Q09428 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
ABCC8Q09428 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
ABCC8Q09428 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
ABCC8Q09428 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
ABCC8Q09428 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
ABCC8Q09428 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
ABCC8Q09428 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC46.81■■■■■ 5.08
ABCC8Q09428 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
ABCC8Q09428 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC46.81■■■■■ 5.08
ABCC8Q09428 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
ABCC8Q09428 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.79■■■■■ 5.08
ABCC8Q09428 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
ABCC8Q09428 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC46.77■■■■■ 5.08
ABCC8Q09428 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
ABCC8Q09428 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
ABCC8Q09428 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
ABCC8Q09428 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC46.75■■■■■ 5.07
ABCC8Q09428 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
ABCC8Q09428 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
ABCC8Q09428 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC46.7■■■■■ 5.07
ABCC8Q09428 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC46.67■■■■■ 5.06
ABCC8Q09428 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC46.67■■■■■ 5.06
ABCC8Q09428 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
ABCC8Q09428 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
ABCC8Q09428 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC46.66■■■■■ 5.06
ABCC8Q09428 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
ABCC8Q09428 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.06
ABCC8Q09428 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC46.62■■■■■ 5.05
ABCC8Q09428 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC46.62■■■■■ 5.05
ABCC8Q09428 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC46.62■■■■■ 5.05
ABCC8Q09428 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
ABCC8Q09428 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
ABCC8Q09428 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
ABCC8Q09428 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC46.6■■■■■ 5.05
ABCC8Q09428 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
ABCC8Q09428 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
ABCC8Q09428 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC46.59■■■■■ 5.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms