Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TAP1Q03518 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TAP1Q03518 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TAP1Q03518 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAP1Q03518 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAP1Q03518 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAP1Q03518 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TAP1Q03518 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAP1Q03518 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TAP1Q03518 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TAP1Q03518 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAP1Q03518 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAP1Q03518 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TAP1Q03518 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TAP1Q03518 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TAP1Q03518 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TAP1Q03518 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TAP1Q03518 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TAP1Q03518 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TAP1Q03518 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TAP1Q03518 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAP1Q03518 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TAP1Q03518 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TAP1Q03518 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TAP1Q03518 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TAP1Q03518 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAP1Q03518 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAP1Q03518 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAP1Q03518 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAP1Q03518 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TAP1Q03518 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TAP1Q03518 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TAP1Q03518 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TAP1Q03518 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAP1Q03518 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAP1Q03518 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAP1Q03518 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAP1Q03518 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAP1Q03518 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAP1Q03518 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAP1Q03518 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAP1Q03518 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAP1Q03518 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAP1Q03518 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TAP1Q03518 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TAP1Q03518 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TAP1Q03518 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAP1Q03518 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAP1Q03518 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAP1Q03518 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAP1Q03518 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAP1Q03518 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAP1Q03518 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAP1Q03518 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TAP1Q03518 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAP1Q03518 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAP1Q03518 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAP1Q03518 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAP1Q03518 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAP1Q03518 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAP1Q03518 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TAP1Q03518 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAP1Q03518 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TAP1Q03518 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TAP1Q03518 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAP1Q03518 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAP1Q03518 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAP1Q03518 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAP1Q03518 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAP1Q03518 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TAP1Q03518 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAP1Q03518 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TAP1Q03518 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TAP1Q03518 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAP1Q03518 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAP1Q03518 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TAP1Q03518 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TAP1Q03518 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAP1Q03518 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAP1Q03518 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAP1Q03518 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAP1Q03518 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAP1Q03518 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TAP1Q03518 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms