Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIST1H1AQ02539 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HIST1H1AQ02539 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIST1H1AQ02539 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIST1H1AQ02539 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIST1H1AQ02539 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIST1H1AQ02539 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIST1H1AQ02539 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST1H1AQ02539 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST1H1AQ02539 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST1H1AQ02539 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST1H1AQ02539 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST1H1AQ02539 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST1H1AQ02539 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST1H1AQ02539 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST1H1AQ02539 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST1H1AQ02539 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIST1H1AQ02539 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIST1H1AQ02539 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST1H1AQ02539 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST1H1AQ02539 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST1H1AQ02539 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST1H1AQ02539 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST1H1AQ02539 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIST1H1AQ02539 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIST1H1AQ02539 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIST1H1AQ02539 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIST1H1AQ02539 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIST1H1AQ02539 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIST1H1AQ02539 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIST1H1AQ02539 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIST1H1AQ02539 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIST1H1AQ02539 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIST1H1AQ02539 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIST1H1AQ02539 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIST1H1AQ02539 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIST1H1AQ02539 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIST1H1AQ02539 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST1H1AQ02539 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST1H1AQ02539 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST1H1AQ02539 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms