Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IL13RA1P78552 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IL13RA1P78552 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IL13RA1P78552 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IL13RA1P78552 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IL13RA1P78552 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IL13RA1P78552 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IL13RA1P78552 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IL13RA1P78552 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IL13RA1P78552 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IL13RA1P78552 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IL13RA1P78552 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IL13RA1P78552 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IL13RA1P78552 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IL13RA1P78552 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IL13RA1P78552 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL13RA1P78552 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL13RA1P78552 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IL13RA1P78552 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL13RA1P78552 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL13RA1P78552 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL13RA1P78552 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL13RA1P78552 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL13RA1P78552 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL13RA1P78552 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL13RA1P78552 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IL13RA1P78552 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IL13RA1P78552 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IL13RA1P78552 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IL13RA1P78552 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IL13RA1P78552 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms