Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IL13RA1P78552 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IL13RA1P78552 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IL13RA1P78552 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IL13RA1P78552 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IL13RA1P78552 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IL13RA1P78552 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IL13RA1P78552 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IL13RA1P78552 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IL13RA1P78552 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IL13RA1P78552 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IL13RA1P78552 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IL13RA1P78552 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IL13RA1P78552 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IL13RA1P78552 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IL13RA1P78552 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IL13RA1P78552 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IL13RA1P78552 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IL13RA1P78552 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IL13RA1P78552 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IL13RA1P78552 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IL13RA1P78552 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IL13RA1P78552 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IL13RA1P78552 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IL13RA1P78552 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IL13RA1P78552 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IL13RA1P78552 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IL13RA1P78552 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IL13RA1P78552 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IL13RA1P78552 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IL13RA1P78552 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IL13RA1P78552 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IL13RA1P78552 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IL13RA1P78552 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IL13RA1P78552 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IL13RA1P78552 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IL13RA1P78552 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IL13RA1P78552 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IL13RA1P78552 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IL13RA1P78552 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IL13RA1P78552 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IL13RA1P78552 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IL13RA1P78552 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IL13RA1P78552 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IL13RA1P78552 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IL13RA1P78552 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IL13RA1P78552 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IL13RA1P78552 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IL13RA1P78552 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IL13RA1P78552 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IL13RA1P78552 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IL13RA1P78552 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IL13RA1P78552 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IL13RA1P78552 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IL13RA1P78552 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IL13RA1P78552 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IL13RA1P78552 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IL13RA1P78552 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IL13RA1P78552 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IL13RA1P78552 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IL13RA1P78552 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IL13RA1P78552 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IL13RA1P78552 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IL13RA1P78552 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IL13RA1P78552 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IL13RA1P78552 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL13RA1P78552 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IL13RA1P78552 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IL13RA1P78552 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IL13RA1P78552 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IL13RA1P78552 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
IL13RA1P78552 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IL13RA1P78552 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IL13RA1P78552 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IL13RA1P78552 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IL13RA1P78552 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IL13RA1P78552 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IL13RA1P78552 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IL13RA1P78552 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IL13RA1P78552 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IL13RA1P78552 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IL13RA1P78552 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IL13RA1P78552 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IL13RA1P78552 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IL13RA1P78552 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IL13RA1P78552 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IL13RA1P78552 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IL13RA1P78552 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IL13RA1P78552 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IL13RA1P78552 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IL13RA1P78552 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IL13RA1P78552 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IL13RA1P78552 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IL13RA1P78552 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IL13RA1P78552 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IL13RA1P78552 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IL13RA1P78552 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IL13RA1P78552 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IL13RA1P78552 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IL13RA1P78552 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms