Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA52P62987 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA52P62987 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA52P62987 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA52P62987 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA52P62987 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA52P62987 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA52P62987 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA52P62987 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA52P62987 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA52P62987 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA52P62987 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA52P62987 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA52P62987 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBA52P62987 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA52P62987 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA52P62987 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA52P62987 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA52P62987 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA52P62987 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA52P62987 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA52P62987 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA52P62987 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBA52P62987 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBA52P62987 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA52P62987 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA52P62987 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBA52P62987 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBA52P62987 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA52P62987 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA52P62987 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA52P62987 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA52P62987 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA52P62987 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA52P62987 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA52P62987 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA52P62987 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA52P62987 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA52P62987 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA52P62987 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA52P62987 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA52P62987 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA52P62987 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA52P62987 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA52P62987 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA52P62987 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA52P62987 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA52P62987 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA52P62987 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA52P62987 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA52P62987 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA52P62987 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA52P62987 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA52P62987 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA52P62987 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA52P62987 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA52P62987 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA52P62987 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA52P62987 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA52P62987 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA52P62987 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA52P62987 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA52P62987 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA52P62987 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA52P62987 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA52P62987 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA52P62987 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA52P62987 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA52P62987 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA52P62987 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA52P62987 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA52P62987 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA52P62987 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA52P62987 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA52P62987 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA52P62987 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA52P62987 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA52P62987 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA52P62987 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA52P62987 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA52P62987 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBA52P62987 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA52P62987 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA52P62987 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA52P62987 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA52P62987 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA52P62987 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA52P62987 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA52P62987 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA52P62987 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA52P62987 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBA52P62987 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA52P62987 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA52P62987 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA52P62987 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBA52P62987 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA52P62987 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA52P62987 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA52P62987 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBA52P62987 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms