Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P62891 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P62891 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P62891 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P62891 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P62891 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P62891 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P62891 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P62891 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P62891 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P62891 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P62891 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P62891 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P62891 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P62891 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P62891 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P62891 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P62891 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P62891 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P62891 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL39P62891 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL39P62891 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL39P62891 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL39P62891 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P62891 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P62891 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P62891 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL39P62891 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL39P62891 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL39P62891 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL39P62891 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL39P62891 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL39P62891 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P62891 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P62891 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P62891 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P62891 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P62891 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P62891 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL39P62891 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL39P62891 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL39P62891 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL39P62891 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL39P62891 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL39P62891 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL39P62891 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL39P62891 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL39P62891 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL39P62891 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL39P62891 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL39P62891 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL39P62891 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL39P62891 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL39P62891 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL39P62891 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL39P62891 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL39P62891 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL39P62891 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL39P62891 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL39P62891 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P62891 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P62891 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P62891 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P62891 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P62891 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL39P62891 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL39P62891 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL39P62891 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P62891 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P62891 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P62891 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL39P62891 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL39P62891 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL39P62891 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL39P62891 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P62891 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P62891 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P62891 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P62891 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL39P62891 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P62891 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P62891 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P62891 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P62891 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P62891 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P62891 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P62891 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P62891 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P62891 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL39P62891 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL39P62891 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL39P62891 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL39P62891 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL39P62891 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P62891 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P62891 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P62891 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL39P62891 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL39P62891 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P62891 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms