Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HERVK_113P62684 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HERVK_113P62684 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HERVK_113P62684 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HERVK_113P62684 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
HERVK_113P62684 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HERVK_113P62684 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HERVK_113P62684 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HERVK_113P62684 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HERVK_113P62684 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HERVK_113P62684 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HERVK_113P62684 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HERVK_113P62684 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HERVK_113P62684 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HERVK_113P62684 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HERVK_113P62684 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HERVK_113P62684 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HERVK_113P62684 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HERVK_113P62684 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HERVK_113P62684 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HERVK_113P62684 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HERVK_113P62684 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HERVK_113P62684 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HERVK_113P62684 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HERVK_113P62684 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HERVK_113P62684 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HERVK_113P62684 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HERVK_113P62684 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HERVK_113P62684 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HERVK_113P62684 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HERVK_113P62684 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HERVK_113P62684 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
HERVK_113P62684 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HERVK_113P62684 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HERVK_113P62684 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HERVK_113P62684 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
HERVK_113P62684 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HERVK_113P62684 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HERVK_113P62684 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HERVK_113P62684 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HERVK_113P62684 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HERVK_113P62684 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HERVK_113P62684 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HERVK_113P62684 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HERVK_113P62684 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HERVK_113P62684 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HERVK_113P62684 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HERVK_113P62684 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HERVK_113P62684 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HERVK_113P62684 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HERVK_113P62684 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HERVK_113P62684 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HERVK_113P62684 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HERVK_113P62684 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HERVK_113P62684 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HERVK_113P62684 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HERVK_113P62684 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HERVK_113P62684 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HERVK_113P62684 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HERVK_113P62684 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HERVK_113P62684 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HERVK_113P62684 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HERVK_113P62684 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
HERVK_113P62684 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HERVK_113P62684 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HERVK_113P62684 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HERVK_113P62684 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HERVK_113P62684 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms