Protein–RNA interactions for Protein: P57086

SCAND1, SCAN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAND1P57086 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAND1P57086 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAND1P57086 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAND1P57086 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAND1P57086 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAND1P57086 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAND1P57086 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAND1P57086 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAND1P57086 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAND1P57086 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAND1P57086 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAND1P57086 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAND1P57086 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAND1P57086 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAND1P57086 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAND1P57086 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAND1P57086 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAND1P57086 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAND1P57086 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAND1P57086 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAND1P57086 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAND1P57086 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAND1P57086 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAND1P57086 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAND1P57086 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAND1P57086 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAND1P57086 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAND1P57086 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAND1P57086 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAND1P57086 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAND1P57086 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAND1P57086 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAND1P57086 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCAND1P57086 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAND1P57086 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAND1P57086 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAND1P57086 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAND1P57086 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAND1P57086 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAND1P57086 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAND1P57086 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAND1P57086 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAND1P57086 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAND1P57086 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAND1P57086 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAND1P57086 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAND1P57086 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAND1P57086 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAND1P57086 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAND1P57086 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAND1P57086 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAND1P57086 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAND1P57086 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAND1P57086 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAND1P57086 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAND1P57086 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAND1P57086 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAND1P57086 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAND1P57086 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAND1P57086 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAND1P57086 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAND1P57086 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAND1P57086 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAND1P57086 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAND1P57086 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAND1P57086 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAND1P57086 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAND1P57086 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAND1P57086 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAND1P57086 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAND1P57086 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAND1P57086 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAND1P57086 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAND1P57086 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAND1P57086 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAND1P57086 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAND1P57086 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAND1P57086 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAND1P57086 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAND1P57086 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAND1P57086 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms