Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX8P57073 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX8P57073 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX8P57073 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX8P57073 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX8P57073 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX8P57073 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX8P57073 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX8P57073 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX8P57073 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX8P57073 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX8P57073 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX8P57073 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX8P57073 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX8P57073 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX8P57073 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX8P57073 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX8P57073 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX8P57073 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX8P57073 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX8P57073 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX8P57073 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX8P57073 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX8P57073 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX8P57073 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX8P57073 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX8P57073 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX8P57073 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX8P57073 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX8P57073 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX8P57073 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX8P57073 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX8P57073 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX8P57073 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX8P57073 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOX8P57073 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX8P57073 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX8P57073 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX8P57073 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX8P57073 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX8P57073 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX8P57073 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX8P57073 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX8P57073 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX8P57073 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX8P57073 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX8P57073 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX8P57073 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX8P57073 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX8P57073 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX8P57073 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX8P57073 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX8P57073 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX8P57073 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX8P57073 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX8P57073 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX8P57073 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX8P57073 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX8P57073 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX8P57073 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX8P57073 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX8P57073 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX8P57073 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX8P57073 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX8P57073 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX8P57073 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX8P57073 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX8P57073 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX8P57073 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX8P57073 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX8P57073 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX8P57073 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX8P57073 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX8P57073 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX8P57073 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX8P57073 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX8P57073 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX8P57073 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX8P57073 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX8P57073 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX8P57073 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX8P57073 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX8P57073 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX8P57073 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX8P57073 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX8P57073 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX8P57073 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX8P57073 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX8P57073 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX8P57073 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX8P57073 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX8P57073 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX8P57073 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX8P57073 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX8P57073 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX8P57073 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOX8P57073 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX8P57073 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX8P57073 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX8P57073 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms