Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAV3P56539 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAV3P56539 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAV3P56539 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAV3P56539 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAV3P56539 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAV3P56539 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAV3P56539 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAV3P56539 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAV3P56539 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAV3P56539 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAV3P56539 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAV3P56539 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAV3P56539 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAV3P56539 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAV3P56539 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAV3P56539 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAV3P56539 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAV3P56539 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAV3P56539 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV3P56539 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV3P56539 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV3P56539 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV3P56539 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAV3P56539 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAV3P56539 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAV3P56539 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAV3P56539 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAV3P56539 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAV3P56539 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAV3P56539 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAV3P56539 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAV3P56539 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAV3P56539 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAV3P56539 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAV3P56539 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAV3P56539 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAV3P56539 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAV3P56539 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAV3P56539 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAV3P56539 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAV3P56539 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAV3P56539 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAV3P56539 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAV3P56539 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAV3P56539 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAV3P56539 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAV3P56539 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAV3P56539 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAV3P56539 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAV3P56539 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAV3P56539 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAV3P56539 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAV3P56539 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAV3P56539 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAV3P56539 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAV3P56539 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CAV3P56539 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAV3P56539 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAV3P56539 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAV3P56539 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAV3P56539 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAV3P56539 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAV3P56539 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAV3P56539 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAV3P56539 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAV3P56539 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAV3P56539 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAV3P56539 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAV3P56539 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAV3P56539 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAV3P56539 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAV3P56539 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAV3P56539 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CAV3P56539 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAV3P56539 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAV3P56539 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV3P56539 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV3P56539 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV3P56539 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV3P56539 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAV3P56539 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAV3P56539 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV3P56539 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV3P56539 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV3P56539 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAV3P56539 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAV3P56539 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAV3P56539 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAV3P56539 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAV3P56539 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAV3P56539 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAV3P56539 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAV3P56539 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAV3P56539 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAV3P56539 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAV3P56539 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAV3P56539 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAV3P56539 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAV3P56539 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms