Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
AP1S2P56377 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP1S2P56377 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
AP1S2P56377 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP1S2P56377 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP1S2P56377 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP1S2P56377 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP1S2P56377 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP1S2P56377 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP1S2P56377 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP1S2P56377 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP1S2P56377 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP1S2P56377 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AP1S2P56377 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP1S2P56377 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP1S2P56377 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP1S2P56377 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP1S2P56377 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP1S2P56377 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP1S2P56377 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
AP1S2P56377 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP1S2P56377 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP1S2P56377 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP1S2P56377 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP1S2P56377 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AP1S2P56377 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
AP1S2P56377 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP1S2P56377 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP1S2P56377 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP1S2P56377 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP1S2P56377 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP1S2P56377 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP1S2P56377 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP1S2P56377 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP1S2P56377 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP1S2P56377 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP1S2P56377 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP1S2P56377 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP1S2P56377 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP1S2P56377 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP1S2P56377 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP1S2P56377 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP1S2P56377 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP1S2P56377 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP1S2P56377 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP1S2P56377 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP1S2P56377 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP1S2P56377 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP1S2P56377 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
AP1S2P56377 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP1S2P56377 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP1S2P56377 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP1S2P56377 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP1S2P56377 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP1S2P56377 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP1S2P56377 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP1S2P56377 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP1S2P56377 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP1S2P56377 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP1S2P56377 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP1S2P56377 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP1S2P56377 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
AP1S2P56377 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AP1S2P56377 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP1S2P56377 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AP1S2P56377 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP1S2P56377 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP1S2P56377 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AP1S2P56377 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AP1S2P56377 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms