Protein–RNA interactions for Protein: P56134

ATP5J2, ATP synthase subunit f, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5J2P56134 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5J2P56134 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5J2P56134 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5J2P56134 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5J2P56134 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5J2P56134 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5J2P56134 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5J2P56134 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5J2P56134 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5J2P56134 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5J2P56134 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5J2P56134 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5J2P56134 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5J2P56134 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5J2P56134 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5J2P56134 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5J2P56134 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5J2P56134 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5J2P56134 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5J2P56134 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5J2P56134 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5J2P56134 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5J2P56134 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5J2P56134 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5J2P56134 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5J2P56134 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5J2P56134 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5J2P56134 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP5J2P56134 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP5J2P56134 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5J2P56134 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5J2P56134 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5J2P56134 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5J2P56134 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5J2P56134 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP5J2P56134 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5J2P56134 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5J2P56134 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5J2P56134 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP5J2P56134 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP5J2P56134 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP5J2P56134 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP5J2P56134 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms